Особенности микробиоты у пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника (проспективное исследование)

Обоснование. Микробиота кишечника, с одной стороны, защищает человека от патогенов, а с другой — сама может являться одним из триггеров и/или медиаторов прогрессирования при воспалительных заболеваниях кишечника (ВЗК). ВЗК поражают преимущественно лиц молодого трудоспособного возраста. Отмечается неуклонный рост заболеваемости ВЗК в последние десятилетия во всем мире и в России. ВЗК существенно влияют на качество жизни, а осложнения приводят к необходимости выполнения хирургических вмешательств, что значительно снижает качество жизни. Цель исследования — изучение состава микробиоты толстой кишки, поиск особенностей микробного спектра у пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника по сравнению с пациентами контрольной группы. Методы. Выполнено проспективное исследование пациентов с ВЗК и пациентов, находящихся на лечении в колопроктологическом стационаре, без воспалительных заболеваний кишечника за 2018–2019 гг. В исследование были включены 157 пациентов ВЗК и 150 пациентов без ВЗК. У всех пациентов исследовались биообразцы стула, которые были подвергнуты микробиологическому и метагеномному исследованию. Результаты. Наиболее часто в просветных фекалиях пациентов с ВЗК (в 60% случаев в титре 10³–10⁹ КОЕ/г) и пациентов без ВЗК (69% случаев в титре 10³–10⁹ КОЕ/г) присутствовали факультативно анаэробные микроорганизмы, среди которых на долю грамнегативных бактерий приходилось 52% случаев, в большей части представленных бациллами, относящимися к порядку Enterobacteriales, только 7% изолированных грамнегативных факультативно аэробных микроорганизмов являлись грамнегативными неферментирующими бактериями (ГОНФБ), представленными пятью родами: Acinetobacter, Burkholderia, Pseudomonas, Stenotrophomonas, Ralstonia. Грампозитивные факультативно анаэробные микроорганизмы в 89% случаев были представлены кокками родов Enterococcus, Streptococcus, Staphylococcus, Micrococcus, Gemella, Globicatella, Granulicatella. По результатам нашего исследования следует обратить особое внимание на присутствие в фекальной микробиоте пациентов с ВЗК редких микроаэрофильных и облигатно анаэробных микроорганизмов Arcobacter butzleri, Gardnerella vaginalis, Aromatoleum aromaticum, Terrisporobacter glycolicus (Clostridium glycolicum), Solobacterium moorei, Alloscardovia omnicolens, Fusobacterium nucleatum, Fusobacterium ulcerans и Dialister micraerophilus, которые не были изолированы от пациентов без ВЗК. Заключение. Своевременная адекватная оценка состава и функциональных характеристик микробиоты по показателям ключевых биомаркеров позволит проводить направленную диагностику и профилактику ближайших и отдаленных последствий воспалительных заболеваний кишечника.