Особенности микробиоты у пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника (проспективное исследование)
- Авторы: Сухина М.А.1,2, Юдин С.М.2, Загайнова А.В.2, Макаров В.В.2, Веселов А.В.1, Аносов И.С.1, Лягина И.А.1, Чистякова Д.А.1, Сафин А.Л.1, Шелыгин Ю.А.1
-
Учреждения:
- Национальный медицинский исследовательский центр колопроктологии имени А.Н. Рыжих
- Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью
- Выпуск: Том 77, № 3 (2022)
- Страницы: 165-171
- Раздел: АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ГАСТРОЭНТЕРОЛОГИИ
- URL: https://journal-vniispk.ru/vramn/article/view/125586
- DOI: https://doi.org/10.15690/vramn1480
- ID: 125586
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Обоснование. Микробиота кишечника, с одной стороны, защищает человека от патогенов, а с другой — сама может являться одним из триггеров и/или медиаторов прогрессирования при воспалительных заболеваниях кишечника (ВЗК). ВЗК поражают преимущественно лиц молодого трудоспособного возраста. Отмечается неуклонный рост заболеваемости ВЗК в последние десятилетия во всем мире и в России. ВЗК существенно влияют на качество жизни, а осложнения приводят к необходимости выполнения хирургических вмешательств, что значительно снижает качество жизни. Цель исследования — изучение состава микробиоты толстой кишки, поиск особенностей микробного спектра у пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника по сравнению с пациентами контрольной группы. Методы. Выполнено проспективное исследование пациентов с ВЗК и пациентов, находящихся на лечении в колопроктологическом стационаре, без воспалительных заболеваний кишечника за 2018–2019 гг. В исследование были включены 157 пациентов ВЗК и 150 пациентов без ВЗК. У всех пациентов исследовались биообразцы стула, которые были подвергнуты микробиологическому и метагеномному исследованию. Результаты. Наиболее часто в просветных фекалиях пациентов с ВЗК (в 60% случаев в титре 103–109 КОЕ/г) и пациентов без ВЗК (69% случаев в титре 103–109 КОЕ/г) присутствовали факультативно анаэробные микроорганизмы, среди которых на долю грамнегативных бактерий приходилось 52% случаев, в большей части представленных бациллами, относящимися к порядку Enterobacteriales, только 7% изолированных грамнегативных факультативно аэробных микроорганизмов являлись грамнегативными неферментирующими бактериями (ГОНФБ), представленными пятью родами: Acinetobacter, Burkholderia, Pseudomonas, Stenotrophomonas, Ralstonia. Грампозитивные факультативно анаэробные микроорганизмы в 89% случаев были представлены кокками родов Enterococcus, Streptococcus, Staphylococcus, Micrococcus, Gemella, Globicatella, Granulicatella. По результатам нашего исследования следует обратить особое внимание на присутствие в фекальной микробиоте пациентов с ВЗК редких микроаэрофильных и облигатно анаэробных микроорганизмов Arcobacter butzleri, Gardnerella vaginalis, Aromatoleum aromaticum, Terrisporobacter glycolicus (Clostridium glycolicum), Solobacterium moorei, Alloscardovia omnicolens, Fusobacterium nucleatum, Fusobacterium ulcerans и Dialister micraerophilus, которые не были изолированы от пациентов без ВЗК. Заключение. Своевременная адекватная оценка состава и функциональных характеристик микробиоты по показателям ключевых биомаркеров позволит проводить направленную диагностику и профилактику ближайших и отдаленных последствий воспалительных заболеваний кишечника.
Полный текст
Открыть статью на сайте журналаОб авторах
Марина Алексеевна Сухина
Национальный медицинский исследовательский центр колопроктологии имени А.Н. Рыжих; Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью
Автор, ответственный за переписку.
Email: marinamari272015@gmail.com
ORCID iD: 0000-0003-4795-0751
SPIN-код: 9577-5290
Scopus Author ID: 57192270856
ResearcherId: AAH-3311-2020
к.б.н.
Россия, Москва; МоскваСергей Михайлович Юдин
Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью
Email: yudin@cspmz.ru
ORCID iD: 0000-0003-2199-8474
SPIN-код: 9706-5936
д.м.н., профессор
Россия, МоскваАнжелика Владимировна Загайнова
Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью
Email: angelikaangel@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-4772-9686
SPIN-код: 6642-7819
Scopus Author ID: 12772760200
к.б.н.
Россия, МоскваВалентин Владимирович Макаров
Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью
Email: makarov@cspmz.ru
ORCID iD: 0000-0002-1907-0098
к.б.н.
Россия, МоскваАлексей Викторович Веселов
Национальный медицинский исследовательский центр колопроктологии имени А.Н. Рыжих
Email: a_veselov82@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-3115-1787
SPIN-код: 9333-8673
к.м.н.
Россия, МоскваИван Сергеевич Аносов
Национальный медицинский исследовательский центр колопроктологии имени А.Н. Рыжих
Email: ivaansv@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-9015-2600
SPIN-код: 4062-6344
к.м.н.
Россия, МоскваИрина Анатольевна Лягина
Национальный медицинский исследовательский центр колопроктологии имени А.Н. Рыжих
Email: lyagina59@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-5434-9062
Россия, Москва
Дарья Алексеевна Чистякова
Национальный медицинский исследовательский центр колопроктологии имени А.Н. Рыжих
Email: mushka1994@list.ru
ORCID iD: 0000-0002-2486-081X
SPIN-код: 7628-3590
Россия, Москва
Антон Люнерович Сафин
Национальный медицинский исследовательский центр колопроктологии имени А.Н. Рыжих
Email: antonyz@rambler.ru
ORCID iD: 0000-0001-8013-3863
SPIN-код: 9418-0508
к.м.н.
Россия, МоскваЮрий Анатольевич Шелыгин
Национальный медицинский исследовательский центр колопроктологии имени А.Н. Рыжих
Email: info@gnck.ru
ORCID iD: 0000-0002-8480-9362
SPIN-код: 7989-8228
д.м.н., профессор, академик РАН
Россия, МоскваСписок литературы
- Khalif IL, Shapina MV. Inflammatory bowel disease treatment in Eastern Europe: current status, challenges and needs. Curr Opin Gastroenterol. 2017;33(4):230–233. doi: https://doi.org/10.1097/MOG.0000000000000370
- Belousova E, Khalif I. Tu1290 Social, Demographic and Clinical Features of Inflammatory Bowel Disease in Russia. Gastroenterology. 2012;142(5):S–794. doi: https://doi.org/10.1016/s0016-5085(12)63083-2
- Lynch SV, Pedersen O. The Human Intestinal Microbiome in Health and Disease. N Engl J Med. 2016;375(24):2369–2379. doi: https://doi.org/10.1056/NEJMra1600266
- Littman DR, Pamer EG. Role of the commensal microbiota in normal and pathogenic host immune responses. Cell Host Microbe. 2011;10(4):311–323. doi: https://doi.org/10.1016/j.chom.2011.10.004
- Nishida A, Inoue R, Inatomi O, et al. Gut microbiota in the pathogenesis of inflammatory bowel disease. Clin J Gastroenterol. 2018;11(1):1–10. doi: https://doi.org/10.1007/s12328-017-0813-5
- Yu LC-H. Microbiota dysbiosis and barrier dysfunction in inflammatory bowel disease and colorectal cancers: exploring a common ground hypothesis. J Biomed Sci. 2018;25(1):79. doi: https://doi.org/10.1186/s12929-018-0483-8
- Frank DN, St Amand AL, Feldman RA, et al. Molecular-phylogenetic characterization of microbial community imbalances in human inflammatory bowel diseases. Proc Natl Acad Sci USA. 2007;104(34):13780–13785. doi: https://doi.org/10.1073/pnas.0706625104
- Gophna U, Sommerfeld K, Gophna S, et al. Differences between Tissue-Associated Intestinal Microfloras of Patients with Crohn’s Disease and Ulcerative Colitis. J Clin Microbiol. 2006;44(11):4136–4141. doi: https://doi.org/10.1128/jcm.01004-06
- El Mouzan M. Fecal microbiota profile in newly-diagnosed crohn disease in children: data from a middle eastern population. Morressier; 2016. doi: https://doi.org/10.26226/morressier.57d034d1d462b80292383670
- Kostic AD, Xavier RJ, Gevers D. The Microbiome in Inflammatory Bowel Disease: Current Status and the Future Ahead. Gastroenterology. 2014;146(6):1489–1499. doi: https://doi.org/10.1053/j.gastro.2014.02.009
- Kang S, Im J. Dysbiosis of the faecal microbiota in patients with Crohn’s disease and their unaffected relatives. Gut. 2011;60(5):631–637. doi: https://doi.org/10.1136/gut.2010.223263
- Sokol H, Pigneur B, Watterlot L, et al. Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients. Proc Natl Acad Sci USA. 2008;105(43):16731–16736. doi: https://doi.org/10.1073/pnas.0804812105
- Round J, Mazmanian S. The gut microbiota shapes intestinal immune responses during health and disease. Nat Rev Immunol. 2009;9(5):313–323. doi: https://doi.org/10.1038/nri2515
- Biedermann L, Rogler G. The intestinal microbiota: its role in health and disease. Eur J Pediatr. 2015;174(2):151–167. doi: https://doi.org/10.1007/s00431-014-2476-2
- Azad MAK, Sarker M, Li T, et al. Probiotic Species in the Modulation of Gut Microbiota: An Overview. Biomed Res Int. 2018;2018:9478630. doi: https://doi.org/10.1155/2018/9478630
- Mazmanian S, Round J, Kasper D. A microbial symbiosis factor prevents intestinal inflammatory disease. Nature. 2008;453(7195):620–625. doi: https://doi.org/10.1038/nature07008
- Sheehan D, Moran C, Shanahan F. The microbiota in inflammatory bowel disease. J Gastroenterol. 2015;50(5):495–507. doi: https://doi.org/10.1007/s00535-015-1064-1
- Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Микросимбиоценоз. — Екатеринбург: УрО РАН, 2014. [Buharin OV, Perunova NB. Mikrosimbiocenoz. Ekaterinburg: UrO RAN; 2014. (In Russ.)]
- Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Симбиотические взаимоотношения человека и микроорганизмов // Физиология человека. — 2012. — Т. 38. — № 1. — С. 128–138. [Buharin OV, Perunova NB. Simbioticheskie vzaimootnosheniya cheloveka i mikroorganizmov // Fiziologiya cheloveka. 2012;38(1):128–138. (In Russ.)]
- Nagao-Kitamoto H, Kamada N. Host-microbial Cross-talk in Inflammatory Bowel Disease. Immune Netw. 2017;17(1):1–12. doi: https://doi.org/10.4110/in.2017.17.1.1
- Schirmer M, Garner A, Vlamakis H, et al. Microbial genes and pathways in inflammatory bowel disease. Nat Rev Microbiol. 2019;17(8):497–511. doi: https://doi.org/10.1038/s41579-019-0213-6
- Colquhoun C, Duncan M, Grant G. Inflammatory Bowel Diseases: Host-Microbial-Environmental Interactions in Dysbiosis. Diseases. 2020;8(2):13. doi: https://doi.org/10.3390/diseases8020013
- Alam M, Amos G, Murphy A, et al. Microbial imbalance in inflammatory bowel disease patients at different taxonomic levels. Gut Pathog. 2020;12:1. doi: https://doi.org/10.1186/s13099-019-0341-6
- Vijay A, Valdes AM. Role of the gut microbiome in chronic diseases: a narrative review. Eur J Clin Nutr. 2022;76(4):489–501. doi: https://doi.org/10.1038/s41430-021-00991-6
- Шендеров Б.А. Медицинская и микробная экология и функциональное питание: в 3 т. Т. 3: Пробиотики и функциональное питание. — М.: ГРАНТЪ, 2001. — 286 с. [Shenderov BA. Medicinskaya i mikrobnaya ekologiya i funkcional’noe pitanie: v 3 t. T. 3: Probiotiki i funkcional’noe pitanie M.: GRANT; 2001. 286 s. (In Russ.)]
Дополнительные файлы
