АНАЛИЗАТОР БИОЧИПОВ КАК КОМПОНЕНТ ОБОРУДОВАНИЯ В ТЕХНОЛОГИИ «ЛАБОРАТОРИЯ-НА-ЧИПЕ»

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Возможности количественного анализа слабых сигналов от закрепленных на подложке ячеек биочиповых матриц, флуоресценция которых сопоставима по интенсивности с люминесценцией подложки, исследованы с помощью специально разработанного широкопольного цифрового микроскопа – высокочувствительного анализатора биочипов. В спектральном диапазоне цианинового красителя Cy5 (λex = 645 нм, λem = 665 нм) проведена оценка относительных уровней собственной люминесценции поверхностей ряда материалов, которые могут служить в качестве подложек для матриц биочипов, применяемых в медицинской диагностике. Показано, что на подложке из черного полибутилентерефталата (черный крастин) анализатор позволяет регистрировать флуоресценцию красителя Су5 при его поверхностной концентрации от трех и более молекул/мкм2.

Об авторах

В. Е Барский

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Email: victorbarsky@gmail.com
Москва, Россия

Д. А Юрасов

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

Г. М Детков

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

С. А Поляков

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

Р. А Мифтахов

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

Г. Ф Штылев

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

И. Ю Шишкин

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

В. Е Кузнецова

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

В. Е Шершов

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

В. А Василисков

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

О. А Заседателева

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

А. В Чудинов

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН

Москва, Россия

Список литературы

  1. https://www.rsc.org/journals-books-databases/aboutjournals/lab-on-a-chip/
  2. Ozer T., McMahon C., and Henry C. S. Advances in paper-based analytical devices. Ann. Rev. Anal. Chem., 13 (1), 85–109 (2020). doi: 10.1146/annurev-anchem- 061318-114845
  3. http://www.moslabo.ru/production/oborudovanie-ipribory-dlya-laboratorii-molekulyarnoj-biologii/
  4. Колчинский А., Грядунов Д., Лысов Ю., Михайлович В., Наседкина Т., Турыгин А., Рубина А., Барский В. и Заседателев А. Молекуляр. биология, 38, 4–13 (2004)
  5. http://www.biochip.ru/lab/apps/tb-biochip.html#:~:tex
  6. http://www.biochip-imb.ru/index.php/test-systems/pathogens/9-hcv-biochip
  7. Fesenko D. O., Chudinov A. V., Surzhikov S. A., and Zasedatelev A. S. Biochip-based genotyping assay for detection of polymorphisms in pigmentation genes associated with cutaneous melanoma. Genet. Test. Mol. Biomarkers, 20 (4), 208–212 (2016). doi: 10.1089/gtmb.2015.0272
  8. Shaskolskiy B., Kravtsov D., Kandinov I., Gorshkova S., Kubanov A., Solomka V., Deryabin D., Dementieva E., and Gryadunov D. Comparative whole-genome analysis of Neisseria gonorrhoeae isolates revealed changes in the gonococcal genetic island and specific genes as a link to antimicrobial resistance. Front. Cell. Infect. Microbiol., 12, 831336 (2022). doi: 10.3389/fcimb.2022.831336
  9. Фесенко Д. О., Ивановский И. Д., Иванов П. Л., Земскова Е. Ю., Поляков С. А., Фесенко О. Е., Филиппова М. А. и Заседателев А. С. Универсальная панель инсерционно-делеционных полиморфизмов ChipID106 для генетической идентификации личности и биочип на ее основе. Молекуляр. биология, 57 (4), 632–646 (2023). doi: 10.31857/S0026898423040067
  10. Фесенко Д. О., Ивановский И. Д., Иванов П. Л., Земскова Е. Ю., Агапитова А. С., Поляков С. А., Фесенко О. Е., Филиппова М. А. и Заседателев А. С. Биочип для генотипирования полиморфизмов, ассоциированных с цветом глаз, волос, кожи, группой крови, половой принадлежностью, основной гаплогруппой Y-хромосомы, и его использование для исследования славянской популяции. Молекуляр. биология, 56 (5), 860–880 (2022).
  11. Lysov Y., Barsky V., Urasov D., Urasov R., Cherepanov A., Mamaev D., Yegorov Y., Chudinov A., Surzhikov S., Rubina A., Smoldovskaya O., and Zasedatelev A. Microarray analyzer based on wide field fluorescent microscopy with laser illumination and a device for speckle suppression. Biomed. Opt. Express, 8 (11), 4798–4808 (2017). doi: 10.1364/BOE.8.004798
  12. http://www.biochip-imb.ru/index.php/biochip-reader/imageware
  13. https://www.moslabo.ru/production/oborudovanie-ipribory-dlya-laboratorii-molekulyarnoj-biologii/sistemy-vizualizacii-kletok-dlya-laboratorii/bioscience-media-fluorowatcher-fluorescentnyj-imedzher-dlya-fotografirovaniya-svetyashchihsya-molekul/

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».