Генетическая диагностика предполагаемых гибридов волка и обыкновенного шакала

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Приведены результаты генетического анализа 11 фенотипически девиантных особей волка, Canis lupus Linnaeus, 1758 sensu lato, из Воронежского государственного природного биосферного заповедника (Черноземная зона европейской части России) и Дагестана (Северный Кавказ, Россия), которые на основании морфологии были идентифицированы как предполагаемые гибриды волка с шакалом. По наследуемой по материнской линии мтДНК (последовательности фрагмента гена цитохрома b) и маркерам отцовской линии Y-хромосомным фрагментам ZfY не выявлено гибридов волка и шакала первого поколения, исключена также принадлежность исследованных особей к гибридам между разными особями F1 волка и шакала последующих поколений. Однако не исключается принадлежность морфологически атипичных особей R сложным гибридам, например различным вариантам бэккроссов. По результатам анализа набора аутосомных микросателлитных локусов предположительно идентифицирован один гибрид второго поколения. Также получены данные, которые можно рассматривать как следы гибридизации и интрогрессии у нескольких особей, идентифицированных как волки. Есть основания предполагать наличие потока генов между популяциями шакала и волка в южных регионах европейской части России, хотя явных указаний на интрогрессию между этими видами в рассматриваемых случаях не обнаружено. В то же время результаты как генетического, так и краниологического исследований позволяют предполагать гибридизацию волков с собаками на тех же территориях.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

П. А. Казимиров

Институт общей генетики им. Н.В. Вавилова Российской академии наук; Всероссийский научно-исследовательский институт охраны окружающей среды

Автор, ответственный за переписку.
Email: farenklaw@gmail.com
Россия, Москва, 119991; Москва, 117628

Ю. С. Белоконь

Институт общей генетики им. Н.В. Вавилова Российской академии наук

Email: farenklaw@gmail.com
Россия, Москва, 119991

М. М. Белоконь

Институт общей генетики им. Н.В. Вавилова Российской академии наук

Email: farenklaw@gmail.com
Россия, Москва, 119991

А. С. Мишин

Воронежский государственный природный биосферный заповедник им. В.М. Пескова

Email: farenklaw@gmail.com
Россия, Воронеж, 394080

В. В. Стахеев

Институт аридных зон, Южный научный центр Российской академии наук

Email: farenklaw@gmail.com
Россия, Ростов-на-Дону, 344006

Ю. А. Яровенко

Прикаспийский институт биологических ресурсов Дагестанского федерального исследовательского центра Российской академии наук

Email: farenklaw@gmail.com
Россия, Махачкала, 367000

А. Ю. Яровенко

Прикаспийский институт биологических ресурсов Дагестанского федерального исследовательского центра Российской академии наук

Email: farenklaw@gmail.com
Россия, Махачкала, 367000

Д. В. Политов

Институт общей генетики им. Н.В. Вавилова Российской академии наук; Всероссийский научно-исследовательский институт охраны окружающей среды

Email: dmitri_p@inbox.ru
Россия, Москва, 119991; Москва, 117628

Список литературы

  1. Lindblad-Toh K., Wade C.M., Mikkelsen T.S. et al. Genome sequence, comparative analysis and haplotype structure of the domestic dog // Nature. 2005. V. 438. № 7069. P. 803–819. https://doi.org/10.1038/nature04338
  2. Galov A., Fabbri E., Caniglia R. et al. First evidence of hybridization between golden jackal (Canis aureus) and domestic dog (Canis familiaris) as revealed by genetic markers // Royal Society Open Science. 2015. V. 2. № 12. https://doi.org/10.1098/rsos.150450
  3. Rykov A.M., Kuznetsova A.S., Tirronen K.F. The first record of the golden jackal (Canis aureus Linnaeus, 1758) in the Russian Subarctic // Polar Biology. 2022. V. 45. № 5. P. 965–970.
  4. Stronen A.V., Bartol M., Boljte B. et al. “Passive surveillance” across species with cross-amplifying molecular markers: the potential of wolf (Canis lupus) genetic monitoring in tracking golden jackal (C. aureus) colonization and hybridization // Hystrix, the Italian J. Mammalogy. 2020. V. 31. № 1. P. 74–76. http://dx.doi.org/10.4404/hystrix-00259-2019
  5. Trouwborst A., Krofel M., Linnell J.D.C. Legal implications of range expansions in a terrestrial carnivore: the case of the golden jackal (Canis aureus) in Europe // Biodiversity and Conservation. 2015. V. 24. № 10. P. 2593–2610. https://doi.org/10.1007/s10531-015-0948-y
  6. Новиков Г.А. Хищные млекопитающие фауны СССР. М.; Л.: АН СССР, 1956. 294 с.
  7. Волк. Происхождение, систематика, морфология, экология / Под ред. Бибикова Д.И. М.: Наука, 1985. 606 c.
  8. Кудактин А.Н., Яровенко Ю.А., Яровенко А.Ю. Современное распространение и экология шакала обыкновенного Canis aureus (L., 1758) в России и на Кавказе // Вестник охотоведенья. 2019. Т. 16. № 1, С. 22–-28.
  9. Rutledge L.Y., White B.N., Row J.R., Patterson B.R. Intense harvesting of eastern wolves facilitated hybridization with coyotes // Ecol. Evol. 2012. V. 2. № 1. P. 19–33. https://doi.org/10.1002%2Fece3.61
  10. Bohling J.H., Waits L. P. Factors influencing red wolf–coyote hybridization in eastern North Carolina, USA // Biol. Conservation. 2015. V. 184. P. 108–116. https://doi.org/10.1016/j.biocon.2015.01.013
  11. Leonard J.A., Echegaray J., Randi E., Vila C. Impact of hybridization with domestic dogs on the conservation of wild canids // Free-Ranging Dogs and Wildlife Conservation / Ed. Gompper M.E., Oxford: Oxford Univ. Press, 2014. P. 170-184.
  12. Barash A., Preiss-Bloom S., Machluf Y. et al. Possible origins and implications of atypical morphologies and domestication-like traits in wild golden jackals (Canis aureus) // Sci. Reports. 2023. V. 13:7388. https://doi.org/10.1038/s41598-023-34533-w
  13. Хейдорова Е.Э., Шпак А.В., Гомель К.В. и др. Молекулярно-генетическая идентификация инвазивного вида – шакала азиатского (Canis aureus) на территории Беларуси // Докл. Нац. академии наук Беларуси. 2018. Т. 62. № 1. С. 86–92.
  14. Рябов Л.С. Волки Черноземья. Воронеж: Изд-во ВГУ, 1993. 168 с.
  15. Smith M.F., Patton J.L. Variation in mitochondrial cytochrome b sequence in natural populations of South American akodontine rodents (Muridae: Sigmodontinae) // Mol. Biol. Evol. 1991. V. 8. № 1. P. 85-103. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040638
  16. Boonyaprakob U., Homsavart S., Noosud J., Tungtrakanpoung R. Cloning and comparative analysis of zinc-finger protein gene on Y-chromosome (ZFY) between Thai Bangkaew dog and other Thai canids // Agriculture and Nat. Resources. 2017. V. 51. № 3. P. 212–217. http://dx.doi.org/10.1016/j.anres.2016.12.007
  17. Galov A., Sindicic M., Gomercic T. et al. PCR-based Y chromosome marker for discriminating between golden jackal (Canis aureus) and domestic dog (Canis lupus familiaris) paternal ancestry // Conservation Genet. Resources. 2014. V. 6. № 2. P. 275–277. https://doi.org/10.1007/s12686-013-0110-7
  18. 18. Akesson M., Liberg O., Sand H. et al. Genetic rescue in a severely inbred wolf population // Mol. Ecol. 2016. V. 25. № 19. P. 4745–4756. https://doi.org/10.1111/mec.13797
  19. Казимиров П.А., Леонтьев С.В., Нечаева А.В. и др. Популяционно-генетическая структура степного волка России и Казахстана по микросателлитным локусам // Генетика. 2022. Т. 58. № 11. С. 1261–1272. https://doi.org/10.31857/S0016675822110042
  20. Anderson E., Thompson E. A model-based method for identifying species hybrids using multilocus genetic data // Genetics. 2002. V. 160. № 3. P. 1217–1229. https://doi.org/10.1093/genetics/160.3.1217
  21. Adams D.C., Collyer M.L., Kaliontzopoulou A., Baken E.K. Geomorph: Software for Geometric Morphometric Analyses. R package version 4.0.6. 2023. https://cran.r-project.org/package=geomorph
  22. Collyer M.L., Adams D.C. {RRPP}: Linear model evaluation with randomized residuals in a permutation procedure // Meth. Ecol. Evol. 2023. V. 9. № 2. P. 1772–1779. https://doi.org/10.1111/2041-210X.13029
  23. R Core Team. R: A Language and Environment for Statistical Computing // 2022. https://www.R-project.org
  24. Harmoinen J., von Thaden A., Aspi J. et al. Reliable wolf-dog hybrid detection in Europe using a reduced SNP panel developed for non-invasively collected samples // BMC Genomics. 2021. V. 22:473. https://doi.org/10.1186/s12864-021-07761-5

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Результат электрофореза ПЦР-продуктов, полученных с использованием наборов праймеров dZFY1F/dZFY2R и YintF2/YintR/Yint2-335. C. a. – Canis aureus, C. l. – Canis lupus, M – размерный стандарт 1кб, длины фрагментов в пн.

Скачать (132KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Результаты краниометрического анализа по 3D-моделям методом главных компонентов.

Скачать (74KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».