Implication of nucleinic acids on spectral properties of solves of complexes of Pd(II) and Pt(II) with aromatic ligands

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

The interaction between nucleic acids (calf thymus DNA and plasmid pCY B3, yeast RNA) and ethylenediamine complexes of Pd(II) and Pt(II) containing aromatic heterocyclic ligands (2,2`-bipyridyl, 1,10-phenanthroline, 2-phenylpyridine, 2-(2`-ethyl)pyridine, 2-phenylpyridine, 2-(2`-ethyl)pyridine) was studied by electron absorption spectroscopy and gel electrophoresis, containing aromatic heterocyclic ligands (2,2`-bipyridyl, 1,10-phenanthroline, 2-phenylpyridine, 2-(2`-thienyl)pyridine, 7,8-benzoquinoline, methyl-2-phenyl-4-quinoline carboxylate, coumarin-6 and Nile red. The applicability of electron absorption spectroscopy to establish the intercalation of organometallic complexes in DNA was demonstrated. Of the investigated complexes, only complexes of Pd(II) with Nile red and coumarin-6 were found to be capable of intensive interaction with RNA. The effective unraveling of the secondary stranding of plasmid DNA detected by gel electrophoresis suggests that these same complexes intercalate into DNA more actively than others.

About the authors

E. V. Demidov

The Herzen State Pedagogical University of Russia

Email: puzyk@mail.ru
St. Petersburg, Russia

M. V. Abramova-Nemesh

The Herzen State Pedagogical University of Russia

St. Petersburg, Russia

T. A. Novikova

The Herzen State Pedagogical University of Russia

St. Petersburg, Russia

A. Y. Plekhanov

Smorodintsev Research Institute of Influenza

St. Petersburg, Russia

V. A. Feoktistova

Information Technologies, Mechanics and Optics University

St. Petersburg, Russia

M. V. Puzyk

The Herzen State Pedagogical University of Russia

Email: puzyk@mail.ru
St. Petersburg, Russia

References

  1. Rosenberg B., van Camp L., Krigas T. // Nature. 1965. V. 205. P. 698; https://doi.org/10.1038/205698a0
  2. Cohen S.M., Lippard S.J. // Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 2001. V. 67. P. 93; https://doi.org/10.1016/s0079-6603(01)67026-0
  3. Hucke A., Park G.Y., Bauer O.B., Beyer G., Köppen C., Zeeh D. et al. // Front. Chem., Sec. Chem. Biol. 2018. V. 6. P. 1. Article 180; https://doi.org/10.3389/fchem.2018.00180
  4. Din M.I., Ali F., Intisar A. // Revue Roumaine de Chimie. 2019. V. 64. № 1. P. 5; https://doi.org/10.33224/rrch.2019.64.1.01
  5. Howe-Grant M., Lippard S.J. // Biochemistry. 1979. V. 18. P. 5762; https://doi.org/10.1021/bi00593a003
  6. Lee S.A., Grimm H., Pohle W., Scheiding W., van Dam L., Song Z. et al. // Phys. Rev. E. 2000. V. 62. № 5. P. 7044; https://doi.org/10.1103/physreve.62.7044
  7. Szabo A., Lee S.A. // J. Biomolec. Struct. Dynamics. 2008. V. 26. № 1. P. 93; https://doi.org/10.1080/07391102.2008.10507227
  8. Brodie C.R., Collins J.G., Aldrich-Wright J.R. // Dalton Trans. 2004. P. 1145; https://doi.org/10.1039/B316511F
  9. Kvam P.-I., Songstad J. // Acta Chem. Scand. 1995. V. 49. P. 313; https://doi.org/10.3891/acta.chem.scand.49-0313
  10. Puzyk M.V., Kotlyar V.S., Antonov N.V., Ivanov Yu.A., Ivanov M.A., Balashev K.P. // Optics Spectroscopy. 2000. V. 89. № 5. P. 721; https://doi.org/10.1134/1.1328126
  11. Rodionova O.A., Puzyk M.V., Balashev K.P. // Optics Spectroscopy. 2008. V. 105. № 1. P. 62; https://doi.org/10.1134/S0030400X08070102
  12. Baichurin R.I., Dulanova I.T., Puzyk Al.M., Pu­zyk M.V. // Optics Spectroscopy. 2022. V. 130. № 14. P. 2108; https://doi.org/10.21883/EOS.2022.14.53995.2253-21
  13. Feoktistova V.A., Baichurin R.I., Novikova T.A., Plekhanov A.Yu., Puzyk, M.V. // Optics Spectroscopy. 2023. № 2. P. 247; https://doi.org/10.21883/OS.2023.02.55018.4480-22
  14. Freifelder D. // Physical biochemistry: applications to biochemistry and molecular biology. San Francisco: W.H. Freeman, 1982.
  15. Watson J.D., Baker T.A., Bell S.P., Gann A., Levine M., Losick R. Molecular Biology of the Gene (5th ed.). New York: Benjamin Cummings. 2003. ISBN 0-8053-4635-X.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2025 Russian Academy of Sciences

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».