Secondary structure of Aβ(1–16) complexes with zinc: A study in the gas phase using deuterium/hydrogen exchange and ultra-high-resolution mass spectrometry


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Complexes of peptide fragment 1–16 of beta-amyloid with transition metals play an important role in the development of a broad class of neurodegenerative diseases, which determines the interest in investigating the structures of these complexes. In this work, we have applied the method of the deuterium/hydrogen exchange in combination with ultra-high-resolution mass spectrometry to study conformational changes in (1–16) beta-amyloid peptide induced by binding of zinc(II) atoms. The efficiency of the deuterium/hydrogen exchange depended on the number of zinc atoms bound to the peptide and on the temperature of the ionization source region. Deuterium/hydrogen exchange reactions have been performed directly in the ionization source. The number of exchanges decreased considerably with an increasing numbers of zinc atoms. The relationship has been described with a damped exponential curve, which indicated that the binding of zinc atoms altered the conformation of the peptide ion by making it less open, which limits the access to inner areas of the molecule.

Об авторах

Yu. Kostyukevich

Moscow Institute of Physics and Technology (State University); Skolkovo Institute of Science and Technology

Email: alex.kononikhin@gmail.com
Россия, Dolgprudny, Moscow oblast, 141701; Moscow, 143026

A. Kononikhin

Moscow Institute of Physics and Technology (State University); Emanuel Institute of Biochemical Physics; Talrose Institute for Energy Problems of Chemical Physics

Автор, ответственный за переписку.
Email: alex.kononikhin@gmail.com
Россия, Dolgprudny, Moscow oblast, 141701; Moscow, 119334; Moscow, 119334

M. Indeykina

Emanuel Institute of Biochemical Physics

Email: alex.kononikhin@gmail.com
Россия, Moscow, 119334

I. Popov

Moscow Institute of Physics and Technology (State University); Emanuel Institute of Biochemical Physics

Email: alex.kononikhin@gmail.com
Россия, Dolgprudny, Moscow oblast, 141701; Moscow, 119334

K. Bocharov

Moscow Institute of Physics and Technology (State University); Talrose Institute for Energy Problems of Chemical Physics

Email: alex.kononikhin@gmail.com
Россия, Dolgprudny, Moscow oblast, 141701; Moscow, 119334

A. Spassky

Emanuel Institute of Biochemical Physics; Talrose Institute for Energy Problems of Chemical Physics

Email: alex.kononikhin@gmail.com
Россия, Moscow, 119334; Moscow, 119334

S. Kozin

Engelhardt Institute of Molecular Biology

Email: alex.kononikhin@gmail.com
Россия, Moscow, 119991

A. Makarov

Engelhardt Institute of Molecular Biology

Email: alex.kononikhin@gmail.com
Россия, Moscow, 119991

E. Nikolaev

Moscow Institute of Physics and Technology (State University); Skolkovo Institute of Science and Technology; Emanuel Institute of Biochemical Physics; Talrose Institute for Energy Problems of Chemical Physics

Email: alex.kononikhin@gmail.com
Россия, Dolgprudny, Moscow oblast, 141701; Moscow, 143026; Moscow, 119334; Moscow, 119334

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Inc., 2017

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».