Определение В-клеточной клональности методом пцр: какой электрофоретический метод лучше?


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цель исследования. Сравнить диагностическую эффективность определения В-клеточной клональности при использовании разных электрофоретических методов. Материалы и методы. Исследован материал 89 пациентов (48 - с В-клеточными лимфомами, 11 - с В-клеточными лимфомами в ремиссии, 24 - с реактивными процессами, 6 - с лимфогранулематозом и Т-клеточными лимфомами) и 10 здоровых доноров. Клональностъ определяли по реаранжировкам генов тяжелой цепи иммуноглобулина (Ig). Использовали оригинальный набор праймеров к FR2 области гена иммуноглобулина. В качестве электрофоретических методов использовали агарозный электрофорез и метод SSCP (анализ конформационного полиморфизма одноцепочечных фрагментов ДНК в полиакриламидном геле). Результаты. Клональность выявляется при наличии более 5,9% клональных клеток от общего количества мононуклеаров или более 20% клональных клеток от общего количества В-лимфоцитов в образце. В нашей работе выявляемость В-клональности при В-клеточных опухолях составила 87,5% (42 из 48 случаев). Ложноотрицательные пробы были дополнительно исследованы при помощи наборов праймеров к FR1- и FR3-областям, однако клональность не была выявлена. Среди реактивных процессов, не B-клеточных опухолей и здоровых доноров клональность была выявлена в 1 случае из 41, у пациента с острой респираторной вирусной инфекцией. Результаты агарозного электрофореза и SSCP-анализа полностью совпали. Заключение. Определение B-клеточной клональности с помощью агарозного электрофореза показало себя как простой, надежный, недорогой и воспроизводимый метод дифференциальной диагностики опухолевой и реактивной лимфопролиферации. Данный метод не подходит для подтверждения ремиссии опухоли или оценки минимальной остаточной болезни в связи с его низкой чувствительностью.

Об авторах

Ю В Сидорова

ГУ Гематологический научный центр РАМН, Москва

Е А Никитин

ГУ Гематологический научный центр РАМН, Москва

Н В Рыжикова

ГУ Гематологический научный центр РАМН, Москва

А Б Судариков

ГУ Гематологический научный центр РАМН, Москва

Список литературы

  1. Никитин Е. А., Ленива Е. А., Судариков А. Б. Роль молекулярных методов в диагностике и мониторинге лимфопролиферативных заболеваний. Гемагол. и трансфузиол. 2001; 3: 19-26.
  2. Bahloul М., Asnafi V., Macintyre Е. Clinical impact of molecular diagnostics in low-grade lymphoma. Best Pract. J. Res. Clin. Haematol. 2005; 18 (1): 97-111.
  3. Harris N. L., Jaffe E. S., Diebold J. et al. WHO classification of neoplasms of the hematopoietic and lymphoid tissues. Hematol. J. 2000; 1 (1): 53-66.
  4. Rezuke W. N., Abernathy E. G., Tsongalis G. J. Molecular diagnosis of B- and T-cell lymphomas: fundamental principles and clinical applications. Clin. Chem. 1997; 43 (10): 1814-1823.
  5. Arber D. A. Molecular diagnostic approach to non-Hodgkin's lymphoma. J. Mol. Diagn. 2000; 2 (4): 178-190.
  6. Sioutos N., Bagg A., Michaud G. Y. et al. Polymerase chain reaction versus Southern blot hybridization: detection of immunoglobulin heavy-chain gene rearrangements. Diagn. Mol. Pathol. 1995; 4: 8-13.
  7. Van Dongen J. J. M., Wolvers-Tettero I. L. M. Analysis of immunoglobulin and T cell receptor genes. Part II: possibilities and limitations in the diagnosis and management of lympho-proliferative diseases and related disorders. Clin. Chim. Acta 1991; 198: 93-174.
  8. Theriault C., Galoin S., Valmary S. et al. PCR analysis of immunoglobulin heavy chain (IgH) and TcR-gamma chain gene rearrangements in the diagnosis of lymphoproliferative disorders: Results of a study of 525 cases. Mod Pathol 2000; 13 (12): 1269-1279.
  9. Diss Т. C., Liu H. X., Du M. Q., Isaacson P. O. Improvements to В cell clonality analysis using PCR amplification of immunoglobulin light chain genes. Mol. Pathol. 2002; 55 (2): 98-101.
  10. Amara K., Trimeche M., Ziadi S. et al. PCR-based clonality analysis of B-cell lymphomas in paraffin-embedded tissues: diagnostic value of immunoglobulin kappa and lambda light chain gene rearrangement investigation. Pathol. Res. Pract. 2006; 202 (6): 425-431.
  11. Bagg A., Braziel R. M., Arber D. A. et al. Immunoglobulin heavy chain gene analysis in lymphomas: a multi-center study demonstrating the heterogeneity of performance of polymerase chain reaction assays. J. Mol. Diagn. 2002; 4 (2): 81-89.
  12. Никитин E. А., Сидорова Ю. В., Рыжикова H. В. и др. Определение Т-клеточной клональности по гамма-цепи Т-клеточного рецептора: окончательные данные. Тер. арх. 2006; 78 (7): 52-57.
  13. Сидорова Ю. В., Никитин Е. А., Пекло М. М. и др. Опыт использования ПЦР для определения Т-клеточной клональности. Тер. арх. 2003; 7: 48-52.
  14. Lefranc М. P., Lefranc G. The Т cell receptor facts book. London: Academic Press; 2001.
  15. Orita M., Iwahana H., Kanazawa H. et al. Detection of polymorphism by human DNA by gel electrophoresis as single-strand conformation polymorphism. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989; 86 (8): 2766-2770.
  16. Lynas C., Howe D. Simple, reliable detection of T cell clones by PCR-LIS-SSCP analysis of TCRg rearrangement. Mol. Cell. Probes 1998; 12: 41-48.
  17. Derksen P. W., Langerak A. W., Kerkhof E. et al. Comparison of different polymerase chain reaction-based approaches for clonality assessment of immunoglobulin heavy-chain gene rearrangements in B-cell neoplasia. Mod. Pathol. 1999; 12 (8): 794-805.
  18. Hoeve M. A., Krol A. D., Philippo K. et al. Limitations of clonality, analysis of В cell proliferations using CDR3 polymerase chain reaction. Mol. Pathol. 2000; 53 (4): 194-200.
  19. Wu X., Feng J., Komori A. et ai. Immunoglobulin somatic hypermutation: double-strand DNA breaks, AID and error-prone DNA repair. J. Clin. Immunol. 2003; 23 (4): 235-246.
  20. Wu X., Kaartinen M. The somatic hypermutation activity of a follicular lymphoma links to large insertions and deletions of immunoglobulin genes. Scand. J. Immunol. 1995; 42 (1): 52-59.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© ООО "Консилиум Медикум", 2008

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
 
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».