R и S-Пируватсодержащий полисахарид клеточной стенки Rathayibacter sp. ВКМ Ac-2927

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Химическими методами и методом спектроскопии ЯМР установлены структуры двух гликополимеров клеточной стенки штаммаRathayibacter sp. ВКМ Ac-2927 (семейство Microbacteriaceae, класс Actinomycetes), изолированного из листьев липы,поражённыхлистовым минёром. Первый полимер, рамноманнан с гетерогенной цепью,построениз регулярно чередующихся остатковα-D-рамнозыиα-D-маннозы, связанных (1→3)- и (1→2)-гликозидными связями, и содержит в минорном количестве боковые остаткиβ-D-ксилопиранозы (структура представлена в тексте). Второй полимер, ацеталированныйR- иS-пировиноградной кислотой, состоит из разветвлённых тетрасахаридных звеньев: →3)-α-D-Galp4,6-(R-Pyr)-(1→3)-β-D-Glcp-(1→6)-[β-D-Galp3,4-(S-Pyr)-(1→4)]-α-D-Manp-(1→. Структура данного полисахарида является новой для представителей Rathayibacterи прокариот в целом. Результаты настоящего исследования свидетельствуют о структурном разнообразии микробных гликополимеров и согласуются с ранее полученными данными о специфичности их состава для видов рода Rathayibacter.

Об авторах

М. С. Кокоулин

Тихоокеанский институт биоорганической химии имени Г.Б. Елякова ДВО РАН

690022 Владивосток, Россия

Н. В. Потехина

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, биологический факультет

Email: potekhina@mail.ru
119234 Москва, Россия

Е. М. Тульская

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова, биологический факультет

119234 Москва, Россия

Ю. В. Оспенников

Всероссийская коллекция микроорганизмов (ВКМ), ФИЦ Пущинский научный центр биологических исследований РАН

142290 Пущино, Московская обл., Россия

Л. И. Евтушенко

Всероссийская коллекция микроорганизмов (ВКМ), ФИЦ Пущинский научный центр биологических исследований РАН

142290 Пущино, Московская обл., Россия

Список литературы

  1. Evtushenko, L. I., and Dorofeeva, L. V. (2012) Genus XXII.RathayibacterZgurskaya, Evtushenko, Akimov and Kalakoutskii 1993, 147VP in Bergey’s manual of systematic bacteriology (Goodfellow, M., Kämpfer, P., Busse, H-J., Trujillo, M. E., Suzuki, K.-I., Ludwig, W., Whitman, W. B., eds) 2nd Edn, vol. 5. Springer, New York, Dordrecht, Heidelberg, London, pp. 953-964.
  2. Potekhina, N. V., Tul’skaya, E. M., Ospennikov, Y. V., and Evtushenko, L. I. (2023) Cell wall glycopolymers as chemotaxonomic characteristics of the genus and speciesRathayibacter,Microbiology,92, S2-S6,https://doi.org/10.1134/S0026261723603822.
  3. Shashkov, A. S., Potekhina, N. V., Tul’skaya, E. M, Dmitrenok, A. S., Senchenkova, S. N., Torgov, V. I., Dorofeeva, L. V., and Evtushenko, L. I. (2024) New lactate- and pyruvate-containing polysaccharide and rhamnomannan with xylose residues from the cell wall ofRathayibacter oskolensisVKM Ac-2121T,Carbohydr. Res.,540, 109145,https://doi.org/10.1016/j.carres.2024.109145.
  4. Шашков А. С., Потехина Н. В, Тульская Е. М., Дмитренок А. С., Сенченкова С. Н., Дорофеева Л. В., Евтушенко Л. И. (2024) Новыерамнозосодержащие гликополимеры клеточной стенкиRathayibacter festucaeВКМ Ac-1390T,Биохимия,89, 2081-2091,https://doi.org/10.31857/S0320972524120051.
  5. Tarlachkov, S. V., Ospennikov, Y. V., Demidov, A. V., Starodumova, I. P., Dorofeeva, L. V., Prisyazhnaya, N. V., et al. (2022) Draft genome sequences of 9 actinobacteria from the familyMicrobacteriaceaeassociated with insect- and nematode-damaged plants,Microbiol. Res. Announc.,11, e00487-22,https://doi.org/10.1128/mra.00487-22.
  6. Potekhina, N. V., Streshinskaya, G. M., Tul’skaya, E. M., and Shashkov, A. S. (2011) In Methods in Microbiology(Rainey, F. A., and Oren, A., eds), Vol. 38, Academic Press/Elsevier, Amsterdam, pp. 131-164,https://doi.org/10.1016/B978-0-12-387730-7.00020-6.
  7. Dmitrenok, A. S., Streshinskaya, G. M., Tul’skaya, E. M., Potekhina, N. V., Senchenkova, S. N., Shashkov, A. S., Bilan, M. I., Starodumova, I. P., Bueva, O. V., and Evtushenko, L. I. (2017) Pyruvylated cell wall glycopolymers ofPromicromonospora citreaVKM Ac-665TandPromicromonospora sp. VKM Ac-1028,Carbohydr. Res.,449, 34-142,https://doi.org/10.1016/j.carres.2017.07.008.
  8. Leontein, K., Lindberg, B., and Lonngren, J. (1978) Assignment of absolute configuration of sugars by g.l.c. of their acetylated glycosides formed from chiral alcohols,Carbohydr. Res.,62, 359-362,https://doi.org/10.1016/S0008-6215(00)80882-4.
  9. Shashkov, A. S., Lipkind, G. M., Knirel, Y. A., and Kochetkov, N. K. (1988) Stereometrical factors determining the effects of glycosylation on the13C chemical shifts in carbohydrates,Magn. Reson. Chem.,26, 735-747,https://doi.org/10.1002/mrc.1260260904.
  10. Garegg, P.J., Jansson, P.-E., Lindberg, B., Lindh, F., and Lönngren, J. (1980) Configuration of the acetal carbon atom of pyruvic acid acetals in some bacterial polysaccharides,Carbohydr. Res.,79, 127-132,https://doi.org/10.1016/S0008-6215(00)83666-6.
  11. Chun, J., Oren, A., Ventosa, A., Christensen, H., Arahal, D. R., da Costa M. S., Rooney, A. P., Yi, H., Xu, X. W., De Meyer, S., and Trujillo, M. E. (2018) Proposed minimal standards for the use of genome data for the taxonomy of prokaryotes,Int. J. Syst. Evol. Microbiol.,68, 461-466,https://doi.org/10.1099/ijsem.0.002516.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).