Способ диагностики послеоперационных осложнений в хирургии


Цитировать

Полный текст

Аннотация

В России и зарубежных странах научные исследования в хирургии принято выполнять в соответствии с постулатами доказательной медицины. Однако реализация этих принципов требует глубоких знаний хирургии и математического моделирования. Авторы: хирург и программист в области машинного обучения разработали математические модели, участвующие в диагностике послеоперационных осложнений в хирургии. В данной работе исследована глубокая полносвязная нейронная сеть для диагностики послеоперационных осложнений на клиническом примере острого аппендицита. В качестве обучающего множества параметров использовался набор, разработанный авторами на основе реальных клинических данных, имеющий номер государственной регистрации в виде базы данных. Для выбора значимых признаков предложен подход на межквантильном  размахе F1-меры и к кодированию составных категориальных признаков, отличающийся компактным представлением. Для предварительной обработки обучающих данных предлагается использовать повышающий автоэнкодер. Автоэнкодер преобразует выбранные признаки в пространство более высокого измерения, что, согласно теореме Ковера, облегчает классификацию признаков. Глубокая нейронная сеть реализована с использованием библиотек Keras и TensorFlow. Для обучения нейросети применен алгоритм Adam с адаптивной скоростью обучения. Для снижения эффекта переобучения использован современный метод регуляризации — dropout. Проведены анализ и выбор метрик качества классификатора. Для оценки характеристик нейросети  использована кросс-валидация по k блокам. Обученная нейронная сеть показала высокие диагностические показатели на тестовом наборе данных. 

Об авторах

Анатолий Анатольевич Соломаха

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Пензенский государственный университет» Министерства науки и высшего образования Российской Федерации

Email: anatoly.solomakha@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-1070-6029

хирург, трансфузиолог, врач высшей категории, к.м.н., доцент, действительный член Российской академии медико-технических наук,  оказывал медицинскую помощь больным, осуществил сбор и обработку данных больных, подготовил базу данных, которая имеет номер государственной регистрации в Роспатенте. Разработал концепцию и дизайн исследования совместно с Горбаченко В. И, принимал участие в написании рукописи статьи, редактировании. 

Россия, Пенза, Российская Федерация

Владимир Иванович Горбаченко

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Пензенский государственный университет» Министерства науки и высшего образования Российской Федерации

Автор, ответственный за переписку.
Email: anatoly.solomakha@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-1012-8855
SPIN-код: 1045-0906

д.т.н., профессор, заведующий кафедрой «Компьютерные технологии», разрабатывал концепцию и дизайн исследования, принимал участие в подготовке базы данных, занимался статистической обработкой данных, нейросетевым моделированием, принимал участие в написании рукописи статьи, её редактировании

Россия, Пенза, Российская Федерация

Список литературы

  1. Совцов С. А. Острый аппендицит: что изменилось в начале нового века?(с комментарием).Хирургия. Журнал им. Н. П. Пирогова.2013;7:37–42.
  2. Simillis C, Symeonides P, Shorthouse AJ, Tekkis PP. A meta-analysis comparing conservative treatment versus acute appendectomy for complicated appendicitis (abscess or phlegmon).Surgery.2010;147:818–829.doi.org/10.1016/s0090-3671(10)79895-5
  3. Prabhudesai SG. Artificial neural Networks: Useful Aid in Diagnosing Acute Appendicitis.World Journal of Surgery.2008; 2:305–309.doi.org/10.1007/s00268-007-9299-5
  4. Park SY, Kim SM. Acute appendicitis diagnosis using artificial neural networks.Technology and health care.2015;23:559–565.doi.org/10.3233/thc-150994
  5. Juliano Y, Rosa OM, Novo NF, Favaro ML. Risk factors associated with complications of acute appendicitis.Journal of Brazilian College of Surgeons.2017;6:560–566.doi.org/10.26226/morressier.58fa1765d462b80290b50f65
  6. Bakti N, Hussain A, El-Hassani S. A rare complication of acute appendicitis: Superior mesenteric vein thrombosis.International Journal of Surgery Case Reports. 2011; 8: 250–252.doi.org/10.1016/j.ijscr.2011.08.003
  7. Brigham KL, Johns MME. Predictive Health: How We Can Reinvent Medicine to Extend Our Best Years.Basic Books.2012; 256.
  8. Miner L, Bolding P, Hilbe J. Practical Predictive Analytics and Decisioning Systems for Medicine: Informatics Accuracy and Cost-Effectiveness for Healthcare Administration and Delivery Including Medical Research. Academic Press.2014;1110.
  9. Joskowicz L. Computer-aided surgery meets predictive, preventive, and personalized medicine. EPMA Journal.2017;8:1–4. doi.org/10.1007/s13167-017-0084-8
  10. Хайкин С. Нейронные сети: полный курс. М.: Вильямс.2006;1104.
  11. Гудфеллоу Я., Бенджио И., Курвиль А. Глубокое обучение.М.: ДМК Пресс, 2018.652с.
  12. Аггарвал Ч. Нейронные сети и глубокое обучение.СПб.: ООО "Диалектика".2020;752.
  13. П. А. Ващенко, А. А. Соломаха, В. И. Горбаченко, А. О. Хазратов. Клинико-лабораторные параметры больных острым аппендицитом. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2014621431. Дата государственной регистрации в Реестре баз данных 10 октября 2014 г.
  14. Zheng A, Casari A. Feature Engineering for Machine Learning: Principles and Techniques for Data Scientists. O'Reilly Media. 2018; 218.
  15. Chandrashekar G, Sahin F. A survey on feature selection methods.Computers & Electrical Engineering.2014;40: 1: 16–28.doi.org/10.1016/j.compeleceng.2013.11.024
  16. Брюс П., Брюс Э. Практическая статистика для специалистов DataScience. СПб.: БХВ Петербург. 2018;304.
  17. Жерон О. Прикладное машинное обучение с помощью Scikit‑Learn, Keras и TensorFlow: концепции, инструменты и техники для создания интеллектуальных систем. СПб.: ООО "Диалектика".2020;1040.
  18. Brownlee J. Why One-Hot Encode Data in Machine Learning? https://machinelearningmastery.com/why-one-hot-encode-data-in-machine-learning/
  19. Хейдт М., Груздев А. В. Изучаем pandas.М.: ДМК Пресс.2019;682.
  20. Scikit-Learn // https://scikit-learn.org/stable/
  21. Шолле Ф. Глубокое обучение на Python. СПб.: Питер.2018; 400.
  22. Keras: The Python Deep Learning library. Usage of callbacks. https://keras.io/callbacks/
  23. Cover TM. Geometrical and Statistical Properties of Systems of Linear inequalities with Applications in Pattern Recognition.IEEE Transactions on Electronic Computers. 1965; EC14: 3: 326–334.doi.org/10.1109/pgec.1965.264137
  24. Zeiler MD. ADADELTA: An Adaptive Learning Rate Method. 2012; https://arxiv.org/abs/1212.5701
  25. Рашка С., Мирджалили В. Python и машинное обучение: машинное и глубокое обучение с использованием Python, scikit-learn и TensorFlow 2. СПБ.: ООО "Диалектика".2020;848.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML


Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».