Polymorphism of microsatellite loci of cattle of the Limousine breed bred in the Republic of Bashkortostan

封面

如何引用文章

全文:

详细

Background. Modern molecular genetic technologies make it possible to monitor genetic resources, both at individual and population levels, and reduce the time of genetic improvement of herds.

Purpose. The given research aims to study the polymorphism of microsatellite loci in Limousine beef cattle bred in the Republic of Bashkortostan. The objectives include analysing the polymorphism of microsatellite loci in Limousine cattle, produced by absorptive crossing of Limousine bulls with dual-purpose cows (Simmental and Bestuzhev) and investigating the genetic structure and indicators of genetic diversity of Limousine cattle subpopulations.

Materials and methods. The research objects are young Limousine cattle of absorptive crossing grown in the limited liability farm "Miasnoi soyuz bashkirskikh proizvoditelei (Meat Union of Bashkir Producers) and SEC Yaroslavsky. The research was conducted in the genetic laboratories of the Bashkir State Pedagogical University named after M. Akmulla, the Federal State Budgetary Educational Institution of the Higher Education the Russian State Agricultural University named after K.A. Timiryazev and Bashkir Agricultural Research Institute of the Ufa Federal Research Centre of the Russian Academy of Sciences.

Results. The analysis of 16 STR loci in Limousine cattle DNA revealed 116 alleles in group I, where the maternal foundation was of the Simmental breed, and 74 alleles in group II, where the maternal foundation was of the Bestuzhev breed. The average number of alleles per locus was 7.25 in group I, and 4.63 in group II. The mean number of effective alleles per locus in groups I and II was 4.14 and 3.27, respectively. Group I exhibited high Shannon index values in the loci TGLA227, BM2113, TGLA53, CSSM66, and INRA023.  The observed and expected heterozygosity levels showed no significant differences. The spatial arrangement of genotypes in the principal coordinate system indicated that the studied subpopulations represent well-consolidated groups, with the preservation of individual genetic diversity in individuals, united by common ancestry and belonging to the same breed.

Conclusion. The obtained results can be used for the rational use of genetic resources of cattle of the Limousine breed and the development of genetically based breeding programs.

作者简介

Tatiana Sedykh

Ufa Branch of the Russian Academy of Sciences, Bashkir State Agrarian Institute; Bashkir State Pedagogical Institute named after M. Akmulla

编辑信件的主要联系方式.
Email: nio_bsau@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5401-3179
俄罗斯联邦, 71, Oktyabrya Ave., Ufa, 450054, Russian Federation; 3a, Oktiabrskoi revolutsii Str., Ufa, 450008, Russian Federation

Diana Gareeva

Ufa Branch of the Russian Academy of Sciences, Bashkir State Agrarian Institute; Bashkir State Pedagogical Institute named after M. Akmulla

Email: diana.razgar@mail.ru
ORCID iD: 0009-0008-8279-6538
俄罗斯联邦, 71, Oktyabrya Ave., Ufa, 450054, Russian Federation; 3a, Oktiabrskoi revolutsii Str., Ufa, 450008, Russian Federation

Niyaz Subkhankulov

Ufa Branch of the Russian Academy of Sciences, Bashkir State Agrarian Institute

Email: niyazsubhankulov@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-5038-2551
俄罗斯联邦, 71, Oktyabrya Ave., Ufa, 450054, Russian Federation

Vladimir Kosilov

Orenburg State Agrarian University

Email: kosilov_vi@bk.ru
ORCID iD: 0000-0003-4754-1771
俄罗斯联邦, 18, Cheliuskintsev Str., Orenburg, 460014, Russian Federation

Dmitry Zorin

Russian State Agrarian University – Moscow Agricultural Academy named after K.A. Timiryazev

Email: ethodmitry@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-5189-1355
俄罗斯联邦, 49, Timiryazevskaya Str., Moscow, 127550, Russian Federation

Marianna Gladkikh

Russian State Agrarian University – Moscow Agricultural Academy named after K.A. Timiryazev

Email: marianna.gladkikh@rgau-msha.ru
ORCID iD: 0000-0002-2304-6058
俄罗斯联邦, 49, Timiryazevskaya Str., Moscow, 127550, Russian Federation

Marina Selionova

Russian State Agrarian University – Moscow Agricultural Academy named after K.A. Timiryazev

Email: selionova@rgau-msha.ru
ORCID iD: 0000-0002-9501-8080
俄罗斯联邦, 49, Timiryazevskaya Str., Moscow, 127550, Russian Federation

参考

  1. Dzhulamanov, K. M., Selionova, M. I., & Gerasimov, N. P. (2018). Genetic characteristics of the Hereford cattle population. Bulletin of Bashkir State Agrarian University, (4(48)), 59–64. https://doi.org/10.31563/1684-7628-2018-48-4-59-64. EDN: https://elibrary.ru/YVBCJN
  2. Dunin, I. M., Tyapugin, S. E., Meshcherov, R. K., Khodykov, V. P., Adzhibekov, V. K., Tyapugin, E. E., & Dyuldina, A. V. (2020). State of beef cattle breeding in the Russian Federation: realities and prospects. Milk and Meat Cattle Breeding, (2), 2–7. https://doi.org/10.33943/MMS.2020.40.30.001. EDN: https://elibrary.ru/TPIWMS
  3. Kalashnikova, L. A., Tyapugin, S. E., Novikov, A. A., & Grigoryan, L. N. (2022). State of the gene pool in pedigree livestock breeding in the Russian Federation. Zootechny, (12), 13–16. https://doi.org/10.25708/ZT.2022.12.85.004. EDN: https://elibrary.ru/IMAXVW
  4. Kayumov, F. G., & Tretyakova, R. F. (2023). Microsatellite DNA analysis of Kalmyk cattle raised in the Republic of Kalmykia. Proceedings of Orenburg State Agrarian University, (4(102)), 261–265. https://doi.org/10.37670/2073-0853-2023-102-4-261-265. EDN: https://elibrary.ru/YROYCV
  5. Kosilov, V. I., Tolochka, V. V., Kalyakina, R. G., Bykova, O. A., Gizatullin, R. S., & Ermolova, E. M. (2021). Effect of crossbreeding cattle of different productivity types on meat quality of crossbreds. Agrarian Bulletin of Primorye, (2(22)), 34–38. EDN: https://elibrary.ru/STQKNC
  6. Lubennikova, M. V., Afanasyev, V. A., & Afanasyev, K. A. (2024). Polymorphism of microsatellite markers in the Shebalino population of marals. Bulletin of Ulyanovsk State Agricultural Academy, (1(65)), 163–169. https://doi.org/10.18286/1816-4501-2 Newton-1-163-169. EDN: https://elibrary.ru/UPQOEE
  7. Nasambaev, E. G., Beishova, I. S., Ulyanova, T. V., & Chernyaeva, S. A. (2023). Study of the genetic structure of Hereford cattle using microsatellite markers. Science and Education, (2-1(71)), 74–82. https://doi.org/10.52578/2305-9397-2023-2-1-74-82. EDN: https://elibrary.ru/GGXULB
  8. Nikolaev, S. V., & Yaluga, V. L. (2024). Genetic characteristics of Holmogor bulls depending on their linear affiliation and level of Holsteinization. Agrarian Science, (6), 77–81. https://doi.org/10.32634/0869-8155-2024-383-6-77-81. EDN: https://elibrary.ru/LHZIEY
  9. Nikolaev, S. V., & Yaluga, V. L. (2023). Comparative genetic characteristics of microsatellite profile of Holsteinized and purebred Holmogor bulls. Agrarian Science, (7), 58–62. https://doi.org/10.32634/0869-8155-2023-372-7-58-62. EDN: https://elibrary.ru/MMSGBJ
  10. Samodelkin, A. G., Basonov, O. A., Asadchiy, A. A., & Kozakov, A. V. (2018). Productivity of crossbreds of various genotypes in absorption crossing of Black-and-White cows with Hereford bulls. Bulletin of Nizhny Novgorod State Agricultural Academy, (4(20)), 38–42. EDN: https://elibrary.ru/YXKHXN
  11. Sedykh, T. A., Gladyr, E. A., Dolmatova, I. Yu., Volkova, V. V., Gizatullin, R. S., & Zinovieva, N. A. (2014). Polymorphism of microsatellite loci in Hereford cattle of various ecological-genetic generations. Bulletin of AIC Stavropol, (3(15)), 121–128. EDN: https://elibrary.ru/SZBVNB
  12. Stolpovsky, Yu. A., Beketov, S. V., Solodneva, E. V., & Kuznetsov, S. B. (2024). Preservation of genetic resources of farm animals. Chief Zootechnician, (3(248)), 3–18. https://doi.org/10.33920/sel-03-2403-01. EDN: https://elibrary.ru/CWYNQN
  13. Tyapugin, S. E., Kalashnikova, L. A., Novikov, A. A., & Semak, M. S. (2022). Genetic examination of breeding products in livestock using blood groups and DNA markers. Zootechny, (5), 2–5. https://doi.org/10.25708/ZT.2022.20.69.001. EDN: https://elibrary.ru/MNGTYS
  14. Kharzinova, V. R., Kudryavtsev, A. V., Semerikova, M. N., & Zinovieva, N. A. (2023). Study of population structure and genetic diversity of Chukotka reindeer breed based on microsatellite analysis. Achievements of Science and Technology of AIC, (9(37)), 87–92. https://doi.org/10.53859/02352451_2023_37_9_87. EDN: https://elibrary.ru/VBESRE
  15. Chasovshchikova, M. A., & Sheveleva, O. M. (2018). Genetic characteristics of Hereford cattle in Tyumen Oblast using microsatellite DNA markers. Bulletin of IrGSXA, (88), 141–150. EDN: https://elibrary.ru/VKFEGI
  16. Shamina, O. V. (2023). The role of beef cattle breeding in forming Russia’s meat balance. Russian Journal of Management, 2(11), 184–190. https://doi.org/10.29039/2409-6024-2023-11-2-184-190. EDN: https://elibrary.ru/YGHQNW
  17. Shatalina, O. S., Tkachenko, I. V., & Yaryshkin, A. A. (2021). Genetic structure of the Holsteinized Black-and-White cattle population based on microsatellite loci. Genetics, 57(2), 205–213. https://doi.org/10.31857/S0016675821020090. EDN: https://elibrary.ru/HUEAQD
  18. Bora, Sh., Tessema, T., & Girmay, G. (2023). Genetic diversity and population structure of selected Ethiopian indigenous cattle breeds using microsatellite markers. Genetics Research, 2023, 1106755. https://doi.org/10.1155/2023/1106755. EDN: https://elibrary.ru/WRLLJG
  19. Petrov, A., & Kamaldinov, E. (2024). Genetic structure of cattle of the Siberian branch by microsatellite loci. Bulletin of NSAU (Novosibirsk State Agrarian University), 72(3), 230–239. https://doi.org/10.31677/2072-6724-2024-72-3-230-239. EDN: https://elibrary.ru/OUEOOC
  20. Stevanovic, J., Stanimirovic, Z., Dimitrijevic, V., & Maletic, M. (2010). Evaluation of 11 microsatellite loci for their use in paternity testing in Yugoslav Pied cattle (YU Simmental cattle). Czech Journal of Animal Science, 55, 221–226. https://doi.org/10.17221/183/2009-CJAS
  21. Ubushieva, V., Gorlov, I., Chimidova, N., & Ubushieva, A. (2024). Microsatellite analysis of Kalmyk cattle. RUDN Journal of Agronomy and Animal Industries, 19, 12–18. https://doi.org/10.22363/2312-797X-2024-19-1-12-18. EDN: https://elibrary.ru/BIJLFM

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML


Creative Commons License
此作品已接受知识共享署名-非商业性使用-禁止演绎 4.0国际许可协议的许可。

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».