Система эукариот в третьем обновлении интерфейса «Супергруппы эукариот: таксономический/биотехнологический интерфейс»: формальные процедуры изменения ранга таксонов

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Проблема согласования рангов высших таксонов эукариот была специально рассмотрена нами в монографии “Nomenclature and rank correlation of higher taxa of eukaryotes”, где, однако, было опущено большинство формальных описаний предлагаемых таксонов в новом ранге. Целью данной статьи является формальное описание ряда таксонов, установленных нами в этой монографии и последующих обновлениях интерфейса: Eocorticata regn. nov., Tsaralia regn. nov., Apusomonadea intraregn. nov., Breviatea intraregn. nov., Eochromista superphyl. nov., Zoosporia superphyl. nov., Eurhodophyta div. nov., Proteorhodophyta div. nov., Anaeramoebea phyl. et cl. nov, Calkinsea phyl. nov., Meteora phyl. nov., Syssomonadea phyl. nov., Chlorodendrophytina subdiv. nov., Chloropicophytina subdiv. nov., Dikaryomycotina subdiv. nov., Pedinophytina subdiv. nov., Picocystophytina subdiv. nov., Sanchytriomycotina subdiv. nov., Agaricomycia supercl. nov, Calcarisporiellomycia supercl. nov., Ceratiomyxomycia supercl. nov., Chytridiomycia supercl. nov., Entomophthoromycia supercl. nov., Entorrhizomycia supercl. nov., Kickxellomycia supercl. nov., Mortierellomycia supercl. nov., Mucoromycia supercl. nov., Myxogasteromycia supercl. nov, Monoblepharomycia supercl. nov., Neocallimastigomycia supercl. nov., Saccharomycia supercl. nov., Acytosteliomycetes cl. nov., Liceomycetes cl. nov., Microheliellida cl. nov., Paratrimastigidea cl. nov., Protosporangiomycetes cl. nov., Pycnococcophyceae cl. nov. Основные направления дальнейшего совершенствования ранговой структуры дерева эукариот мы видим в 1) незначительном увеличении числа супергрупп, описанных для редких и новых таксонов Amoebozoa и TSAR, а также неидентифицированных нуклеотидных последовательностей; 2) компактизации системы Fungi и Metazoa с более широким использованием вставочных таксономических категорий и 3) дальнейшей автоматизации процедуры ранжирования таксонов и новых решений проблемы оценки ранга «орфанных таксонов».

Об авторах

Иван Викторович Змитрович

Ботанический институт им. В. Л. Комарова Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: iv_zmitrovich@mail.ru

д-р биол. наук, ведущий научный сотрудник лаборатории систематики и географии грибов Ботанического института им. В.Л. Комарова РАН

Россия, Санкт-Петербург

Владимир Вениаминович Перелыгин

Санкт-Петербургский государственный химико-фармацевтический университет Министерства
здравоохранения Российской Федерации

Email: vladimir.pereligin@pharminnotech.com

д-р мед. наук, профессор, заведующий кафедрой промышленной экологии Санкт-Петербургского государственного химико-фармацевтического университета Министерства здравоохранения Российской Федерации

Россия, Санкт-Петербург

Михаил Владимирович Жариков

Санкт-Петербургский государственный химико-фармацевтический университет Министерства
здравоохранения Российской Федерации

Email: zharikov.mihail@pharminnotech.com

ст. лаборант кафедры промышленной экологии Санкт-Петербургского государственного химико-фармацевтического университета Министерства здравоохранения Российской Федерации

Россия, Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Sweetlove L. Number of species on Earth tagged at 8.7 million // Nature. 2011. doi: 10.1038/news.2011
  2. Старобогатов Я. И. Естественная система и искусственные системы (цель и принципы работы систематика) // Вестник зоологии. 1989. № 6. С. 3–7.
  3. Змитрович И. В., Псурцева Н. В., Белова Н. В. Эволюционно-таксономические аспекты поиска и изучения лигнинразрушающих грибов – активных продуцентов окислительных ферментов // Микология и фитопатология. 2007. Т. 41. Вып. 1. С. 57–78.
  4. Змитрович И. В., Перелыгин В. В., Жариков М. В. Супергруппы эукариот глазами биотехнолога. Система эукариот и необходимость создания таксономического/биотехнологического интерфейса // Формулы Фармации. 2022. Т. 3. № 4. С. 52–65. doi: 10.17816/phf101311
  5. Zmitrovich I. V., Perelygin V. V., Zharikov M. V. Eukaryotic supergroups: Taxonomy/Biotechnology interface. 2022. https://supergroups.ru
  6. Zmitrovich I. V., Perelygin V. V., Zharikov M. V. Eukaryotic supergroups: Taxonomy/Biotechnology interface. 2023. https://supergroups.ru
  7. Zmitrovich I. V., Perelygin V. V., Zharikov M. V. Eukaryotic supergroups: Taxonomy/Biotechnology interface. 2024. https://supergroups.ru
  8. Bremer K., Humphries C. J., Mishler B. D., Churchill S. P. On cladistic relationships in green plants // Taxon. 1987. V. 36 (2). P. 339–349.
  9. Chase M. W., Reveal J. L. A phylogenetic classification of the land plants to accompany APG III // Bot. J. Linn. Soc. 2009. V. 161 (2). P. 122–127.
  10. Zmitrovich I. V., Perelygin V. V., Zharikov M. V. Nomenclature and rank correlation of higher taxa of eukaryotes: monograph. Moscow: INFRA-M, 2022. 183 p.
  11. Zmitrovich I. V., Perelygin V. V., Zharikov M. V. System of eukaryotes in the third update of the interface “Eukaryotic supergroups: Taxonomy/Biotechnology interface” (2024) // Pharmacy Formulas. 2024. V. 6 (3). P. 48–54 (in Russ.). doi: 10.17816/phf639995
  12. Queiroz de K., Cantino P., Gauthier J. (eds). Phylonyms. A companion to the PhyloCode. 1st edn. CRC Press, Boca Raton, 2020. 281 p.
  13. Ride W. D.L., Cogger H. G., Dupuis C. et al. International Code of Zoological Nomenclature. Fourth edition. Tipografia La Ga-rangola, Padova, 2000.
  14. Turland N. J., Wiersema J. H., Barrie F. R. et al. International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants (Shenzhen Code). Regnum Vegetabile 159. Koeltz Botanical Books, Glashütten, 2018.
  15. Linnaeus C. Species Plantarum. T. 2. L. Salm, Holm, 1753.
  16. Fries E. M. Systema mycologicum, sistens fungorum ordines, genera et species, hucusque cognitas, quas ad normam methodi naturalis determinavit, disposuii atque descripsit. V. 1. Gryphiswald, 1821.
  17. Persoon C. Synopsis methodica fungorum. Gottingae, 1801.
  18. May T. W., Redhead S. A., Bensch K. et al. Chapter F of the International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants as approved by the 11th International Mycological Congress, San Juan, Puerto Rico, July 2018 // IMA Fungus. 2019. V. 10. P. 21. doi: 10.1186/s43008-019-0019-1
  19. Moore R. T. Proposal for the recognition of super ranks // Taxon. 1974. V. 23 (4). P. 650–652.
  20. Yubuki N., Edgcomb V. P., Bernhard J. M. et al. Ultrastructure and molecular phylogeny of Calkinsia aureus: cellular identity of a novel clade of deep-sea euglenozoans with epibiotic bacteria. BMC Microbiol. 2009. V. 9. Art. 16. doi: 10.1186/1471-2180-9-16
  21. Brown M. W., Sharpe S. C., Silberman J. D. et al. Phylogenomics demonstrates that breviate flagellates are related to opisthokonts and apusomonads // Proc. Roy. Soc. London B. Biol. Sci. 2013. V. 280 (1769). P. 17–55. doi: 10.1098 /rspb.2013.1755
  22. Sheikh S., Thulin M., Cavender J. C. et al. A new classification of the Dictyostelids // Protist. 2018. V. 169 (1). P. 1–28. doi: 10.1016/j.protis.2017.11.001.
  23. Kendrick B. The fifth kingdom. Waterloo, 1985. 364 p.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Эко-Вектор, 2024

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».