ECOLOGICAL AND GENETIC ANALYSIS OF POPULATION STRUCTURE OF POPULUS TREMULA L.IN PERM REGION


Cite item

Full Text

Abstract

The wide geographical and ecological distribution of aspens (Populus tremula L.) indicates its high adaptive potential. The ISSR-analysis of DNA polymorphisms in seven natural populations of Populus tremula L. (in the Perm region) was performed. Total of 119 bands were obtained of which 87 (73.1 %) were polymorphic. Seven natural populations of P. tremula possess different levels of genetic diversity, and there was a high level of genetic differentiation between the populations (GST = 0,550). The results of the study are promising for development of further programs of cultivation and preservation of valuable deciduous tree species.

About the authors

Тatiana N Svetlakova

Perm State Humanitarian-Pedagogical University, Perm, Perm Krai, RF

Email: atea2@yandex.ru

Irina V Boboshina

Perm State Humanitarian-Pedagogical University, Perm, Perm Krai, RF

Email: coccinella@yandex.ru 614012, Perm, Bukireva st., 15

Svetlana V Boronnikova

Perm State Humanitarian-Pedagogical University, Perm, Perm Krai, RF

Email: Svboronikova@yandex.ru

Julia S Nechaeva

Perm State Humanitarian-Pedagogical University, Perm, Perm Krai, RF

Email: yulianechaeva@mail.ru 614012, Perm, Bukireva st., 15

References

  1. Молекулярная генетика: учеб.-метод. пособие, 2007. Под ред С. В. Боронниковой. Пермь: Перм. ун-т. 150 с.
  2. Овеснов С. А., 1997. Конспект флоры Пермской области. Пермь: Изд-во Перм. Ун-та. С. 82.
  3. Светлакова Т. Н., Бобошина И. В., Нечаева Ю. С. и др., 2012. Генетическая дифференциация популяций Populus tremula L. в Пермском крае на основании полиморфизма ISSR-маркеров // Аграрный Вестник Урала. № 3 (95). С. 11–13.
  4. Brunner A. M., Busov V. B., Strauss S. H., 2004. Poplar genome sequence: functional genomics in an ecologically dominant plant species // Trends in Plant Science. Vol. 9, № 1. P. 49–56.
  5. Chen Ke, Peng Youhong, 2010. AFLP analysis of genetic diversity in Populus Cathayana Rehd originating from southeastern Qinghai-tibetan plateau of China. Pak. J. Bot., 42(1): 117–127.
  6. Gao J., Zhang S., Qi L., Zhang Y., 2006. Application of ISSR-Markers to Fingerprinting of Elite Cultivars (Varieties/Clones) From Different Sections of the Genus Populus L. // Silvae Genetica. Vol. 55, N 1. P. 1–6.
  7. Genetics and Genomics of Populus, 2010. Series: Plant Genetics and Genomics: Crops and Models, Vol. 8/Jansson, Stefan; Bhalerao, Rishikesh; Groover, Andrew (Eds.). 1st Edition.
  8. Karron J. D., 1987. A comparison of levels of genetic polymorphism and self-compatibility in geographically restricted and widespread plant congeners // Evol. Ecol. Vol. 1. P. 47–58.
  9. Kimura M., Crow J. F., 1964. The number of alleles that can be maintained in a finite population // Genetics (US). Vol. 49. P. 725–738.
  10. Lexer C., Fay M. F.,. Joseph J. A et al., 2005. Barrier to gene flow between two ecologically divergent Populus species, P. alba (white poplar) and P. tremula (European aspen): the role of ecology and life history in gene introgression // Molecular Ecology. № 14. P. 1045–1057.
  11. Li shifeng, Zhangbo, Chen yin et al., 2006. Analysis of Genetic Diversity of Populus deltoides gemplasm by SSRs. International poplar symposium. Nanjing, China.
  12. Nei M., 1987. Molecular evolutionary genetics. N. Y.: Columbia Univ. press, 512 p.
  13. Nei M., 1975. Molecular population genetics and evolution. Amsterdam. 278 p.
  14. Nei M., Li W.-H., 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 76. P. 5269–5273
  15. Peakall R., Smouse P. E., 2006. GenAlEx6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Not. Vol. 6. P. 288–295.
  16. Rogers S. O., Bendich A. J., 1985. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues // Plant Molecular Biology. Vol. 5. Р. 69–76.
  17. Wang J., Wu Y., Ren G., Guo Q., Liu J. et al., 2011. Genetic Differentiation and Delimitation between Ecologically Diverged Populus euphratica and P. pruinosa. PLoS ONE 6(10): e26530. doi:10.1371 / journal.pone.0026530.
  18. Williams J. G. K., Kubelik A. R., Livak K. J. et al., 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucl. Acids Res. Vol. 18. P. 6531–6535.
  19. Yeh F. C., Yang R. C., Boyle T. B. J., Ye Z. H., Mao J. X., 1997.POPGENE, the user-friendly shareware for population genetic analysis. Molecular Biology and Biotechnology Center, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada
  20. Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D., 1994.Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification // Genomics. Vol. 20. P. 176–183.
  21. Nei M., 1972. Genetic distance between populations // Amer. Naturalist. Vol. 106. P. 283–292.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2012 Svetlakova Т.N., Boboshina I.V., Boronnikova S.V., Nechaeva J.S.

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».