Эколого-генетический анализ популяционной структуры Populus tremula l. в Пермском крае


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Широкое географическое и экологическое распространение тополя дрожащего или осины (Populus tremula L.) свидетельствует о ее высоком адаптационном потенциале. Проведен ISSR-анализ полиморфизма ДНК в семи природных популяциях в Populus tremula L.в Пермском крае. Выявлено 119 ISSR-маркеров, из которых 87 (73,1 %) полиморфны.Семь природных популяций P. tremula обладают различными уровнями генетического разнообразия, наблюдается высокий уровень генетической дифференциации в популяциях (GST = 0,55). Результаты исследования являются перспективными для разработки дальнейших программ разведения и сохранения ценных лиственных древесных видов растений.

Об авторах

Татьяна Николаевна Светлакова

Пермский государственный гуманитарно-педагогический университет, Пермь, Пермский Край, РФ

Email: atea2@yandex.ru

Ирина Викторовна Бобошина

Пермский государственный гуманитарно-педагогический университет, Пермь, Пермский Край, РФ

Email: coccinella@yandex.ru 614012, Perm, Bukireva st., 15

Светлана Витальевна Боронникова

Пермский государственный гуманитарно-педагогический университет, Пермь, Пермский Край, РФ

Email: Svboronikova@yandex.ru

Юлия Сергеевна Нечаева

Пермский государственный гуманитарно-педагогический университет, Пермь, Пермский Край, РФ

Email: yulianechaeva@mail.ru 614012, Perm, Bukireva st., 15

Список литературы

  1. Молекулярная генетика: учеб.-метод. пособие, 2007. Под ред С. В. Боронниковой. Пермь: Перм. ун-т. 150 с.
  2. Овеснов С. А., 1997. Конспект флоры Пермской области. Пермь: Изд-во Перм. Ун-та. С. 82.
  3. Светлакова Т. Н., Бобошина И. В., Нечаева Ю. С. и др., 2012. Генетическая дифференциация популяций Populus tremula L. в Пермском крае на основании полиморфизма ISSR-маркеров // Аграрный Вестник Урала. № 3 (95). С. 11–13.
  4. Brunner A. M., Busov V. B., Strauss S. H., 2004. Poplar genome sequence: functional genomics in an ecologically dominant plant species // Trends in Plant Science. Vol. 9, № 1. P. 49–56.
  5. Chen Ke, Peng Youhong, 2010. AFLP analysis of genetic diversity in Populus Cathayana Rehd originating from southeastern Qinghai-tibetan plateau of China. Pak. J. Bot., 42(1): 117–127.
  6. Gao J., Zhang S., Qi L., Zhang Y., 2006. Application of ISSR-Markers to Fingerprinting of Elite Cultivars (Varieties/Clones) From Different Sections of the Genus Populus L. // Silvae Genetica. Vol. 55, N 1. P. 1–6.
  7. Genetics and Genomics of Populus, 2010. Series: Plant Genetics and Genomics: Crops and Models, Vol. 8/Jansson, Stefan; Bhalerao, Rishikesh; Groover, Andrew (Eds.). 1st Edition.
  8. Karron J. D., 1987. A comparison of levels of genetic polymorphism and self-compatibility in geographically restricted and widespread plant congeners // Evol. Ecol. Vol. 1. P. 47–58.
  9. Kimura M., Crow J. F., 1964. The number of alleles that can be maintained in a finite population // Genetics (US). Vol. 49. P. 725–738.
  10. Lexer C., Fay M. F.,. Joseph J. A et al., 2005. Barrier to gene flow between two ecologically divergent Populus species, P. alba (white poplar) and P. tremula (European aspen): the role of ecology and life history in gene introgression // Molecular Ecology. № 14. P. 1045–1057.
  11. Li shifeng, Zhangbo, Chen yin et al., 2006. Analysis of Genetic Diversity of Populus deltoides gemplasm by SSRs. International poplar symposium. Nanjing, China.
  12. Nei M., 1987. Molecular evolutionary genetics. N. Y.: Columbia Univ. press, 512 p.
  13. Nei M., 1975. Molecular population genetics and evolution. Amsterdam. 278 p.
  14. Nei M., Li W.-H., 1979. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Vol. 76. P. 5269–5273
  15. Peakall R., Smouse P. E., 2006. GenAlEx6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Not. Vol. 6. P. 288–295.
  16. Rogers S. O., Bendich A. J., 1985. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues // Plant Molecular Biology. Vol. 5. Р. 69–76.
  17. Wang J., Wu Y., Ren G., Guo Q., Liu J. et al., 2011. Genetic Differentiation and Delimitation between Ecologically Diverged Populus euphratica and P. pruinosa. PLoS ONE 6(10): e26530. doi:10.1371 / journal.pone.0026530.
  18. Williams J. G. K., Kubelik A. R., Livak K. J. et al., 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers // Nucl. Acids Res. Vol. 18. P. 6531–6535.
  19. Yeh F. C., Yang R. C., Boyle T. B. J., Ye Z. H., Mao J. X., 1997.POPGENE, the user-friendly shareware for population genetic analysis. Molecular Biology and Biotechnology Center, University of Alberta, Edmonton, Alberta, Canada
  20. Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D., 1994.Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification // Genomics. Vol. 20. P. 176–183.
  21. Nei M., 1972. Genetic distance between populations // Amer. Naturalist. Vol. 106. P. 283–292.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Светлакова Т.Н., Бобошина И.В., Боронникова С.В., Нечаева Ю.С., 2012

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.
 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».