Том 11, № 1 (2013)
- Год: 2013
- Статей: 11
- URL: https://journal-vniispk.ru/ecolgenet/issue/view/129
- DOI: https://doi.org/10.17816/ecogen111
Статьи
Генетика и эпигенетика старения и долголетия
Аннотация
В обзоре рассмотрены основные группы генов, определяющих скорость старения и продолжительность жизни модельных животных и человека. Основное внимание уделено генам инсулин/IGF-1-, PI3K-, TOR-, MAPK-, NF-kB-, TGF-β-, WNT-сигнальных путей, генам стрессоустойчивости (шаперонам, генам антиоксидантной защиты, автофагии, протеасомальной деградации белков, репарации ДНК) и генам клеточного старения (pRB, p21, p16, p53). Рассмотрены группы генов, изменяющих свою активность при старении человека и эпигенетические механизмы возраст-зависимых изменений
Экологическая генетика. 2013;11(1):3-11
3-11
Адаптивная и прогрессивная эволюциярастительно-микробного симбиоза
Аннотация
У N2-фиксирующих симбионтов бобовых растений (ризобий) эволюция полезных для хозяина(«альтруистических») признаков происходит в популяциях, колонизирующих субклеточные компартменты клубеньков (инфекционные нити, симбиосомы). Эти компартменты возникают в результате коэволюции партнеров, которая связана с усложнением трофических и регуляторных взаимодействий, определяющих экологическую эффективность симбиоза. Их анализ позволяет изучать соотношение механизмов адаптивной и прогрессивной эволюции симбиоза, которое остается неясным для свободно-живущих организмов
Экологическая генетика. 2013;11(1):12-22
12-22
Влияние гиперэкспрессии гена АРР человека на холинергические и дофаминергические нейроны Drosophila melanogaster
Аннотация
Исследовано влияние экспрессии гена белка предшественника амилоида (АРР) на популяции холинергических и дофаминергических нейронов. Количество холинергических нейронов, измеренное по уровню общей флуоресценции в мозге, было одинаковым в контрольной и опытных линиях в первые дни жизни мух, и снижалось в линиях, экспрессирующих АРР с возрастом. Количество дофаминергических нейронов в линиях, экспрессирующих АРР, было достоверно ниже, начиная с 15-го дня. Нейродегенерация сопровождалась уменьшением способности мух к обучению и запоминанию как для линий, экспрессирующих только АРР (АРР-Swedish), так и для линий с образованием амилоидного пептида бета (Аβ).
Экологическая генетика. 2013;11(1):23-31
23-31
Инфицированность эндосимбиотической бактерией Wolbachia видов блох (Siphonaptera: Insecta) Свердловской области и Хабаровского края
Аннотация
Матерински наследуемая симбиотическая бактерия Wolbachia широко распространена среди членистоногих и некоторых нематод. Она обнаружена во всех главных отрядах насекомых, но некоторые таксономические группы остаются мало исследованными.Мы провели скрининг коллекции одной из таких групп, а именно 15 видов блох (Siphonaptera), 252 образца, собранных на территории Свердловской области и Хабаровского края. Для шести видов впервые установлен факт инфицированности Wolbachia. На основании анализа литературных и наших данных мы оцениваем, что как минимум 500 видов из 2 тыс. описанных к настоящему времени могут оказаться инфицированными Wolbachia
Экологическая генетика. 2013;11(1):32-35
32-35
Возрастная динамика обонятельных контактов у самцов лабораторных мышей в условияхсоциальной конкуренции: роль генотипа
Аннотация
Назо-назальные и назо-аногенитальные контакты между животными как составная часть хемокоммуникации необходимы для поддержания этологической структуры популяции. При встрече особей обнюхивание обычно предшествует дальнейшим взаимодействиям, и сообщает им информацию о физиологическом и социальном статусе, возрасте, половой принадлежности и состоянии здоровья партнера. Цель настоящей работы состояла в том, чтобы исследовать генетические и онтогенетические (возрастные) особенности формирования обонятельных контактов у самцов лабораторных мышей в период полового созревания. Самцов мышей инбредных линий CBA/Lac и РТ содержали в генетически гетерогенных парах с 41-го по 70-й день жизни. Уже в первые сутки парного содержания в результате агонистических взаимодействий между самцами наблюдалось установление социальной иерархии, в каждой паре выделялся доминант и субординант. Оценка обонятельного поведения у каждого партнера проводилась по числу назо-назальных и назо-аногенитальных обнюхиваний. Самцы линии CBA/Lac вне зависимости от социального ранга или возраста чаще обнюхивали своих оппонентов, чем самцы РТ. В период с 60 по 70 день жизни у самцов линии CBA/Lac вне зависимости от социального ранга происходило увеличение частоты обнюхиваний, а у самцов линии РТ достоверных возрастных изменений в частоте назо-назальных и назо-аногенитальных контактов не наблюдалось. Проведенное исследование выявило существенное влияние генотипа на формирование паттерна назо-назальных и назо-аногенитальных контактов у самцов лабораторных мышей
Экологическая генетика. 2013;11(1):36-41
36-41
Поиск новых факторов, влияющих на процесстерминации трансляции у дрожжей Saccharomyces cerevisiae
Аннотация
Для поиска белков, взаимодействующих с фактором терминации трансляции eRF1, кодируемых у дрожжей Saccharomyces сerevisiae геном SUP45, проводили скрининг библиотеки дрожжевых генов на мультикопийной плазмиде. Этот подход позволил выявить ген EСM23, увеличение экспрессии которого приводило к понижению жизнеспособности нонсенс-мутантов sup45. Сверхэкспрессия этого гена приводила также к антисупрессорному эффекту, не влияя при этом на количество белка eRF1 в клетке. Обсуждаются возможные механизмы влияния гена EСM23 на жизнеспособность нонсенс-мутантов по гену SUP45
Экологическая генетика. 2013;11(1):42-48
42-48
Сверхэкспрессия генов, кодирующих аспарагин-глутамин обогащенные транскрипционныефакторы, вызывает нонсенс-супрессиюу дрожжей Saccharomyces cerevisiae
Аннотация
Ранее нами был проведен поиск генов, сверхэкспрессия которых вызывает у дрожжей Saccharomyces cerevisiae нонсенс-супрессию на фоне модифицированных вариантов SUP35. В данном исследовании мы анализировали влияние на этот процесс генов, кодирующих аспарагин-глутамин обогащенные транскрипционные факторы. Нами показано, что сверхэкспрессия генов ABF1, GLN3, FKH2, MCM1, MOT3 и REB1 влияет на нонсенс-супрессию у S. cerevisiae. Полученные данные свидетельствуют о том, что некоторые транскрипционные факторы могут опосредовано регулировать терминацию трансляции в живой клетке
Экологическая генетика. 2013;11(1):49-58
49-58
Rol-гены Agrobacterium rhizogenes
Аннотация
В обзоре обобщена информация о rol-генах, входящих в состав Т-ДНК Ri-плазмид Agrobacterium rhizogenes. Обсуждается структура каждого из rol-генов и их регуляторных последовательностей, а также возможные функции, которые могут выполнять rol-гены, будучи перенесенными в растение
Экологическая генетика. 2013;11(1):59-68
59-68
МОЛЕКУЛЯРНЫЙ АНАЛИЗ ГЕНОВ, КОДИРУЮЩИХ БЕЛКИ КЛЕТОЧНОГО ДЕЛЕНИЯ И ПРИЛЕЖАЩИХ ГЕНОВ ЦИАНОБАКТЕРИИ PLEUROCAPSA SP
Аннотация
На примере Pleurocapsa sp. CALU 1126 впервые для группы плеврокапсовых цианобактерий реконструированы нуклеотидные последовательности гена белка клеточного деления FtsZ и прилежащих участков генома. Сопоставление данного локуса с соответствующими участками генома других цианобактерий указывает на различия в филогении, прослеживаемой по разным генам
Экологическая генетика. 2013;11(1):69-76
69-76
Теоретический анализ показателей предсказательной эффективности бинарных генетических тестов
Аннотация
Представлен свод формул для показателей распознающей и предсказательной способностей бинарных генетических тестов. Охарактеризована их зависимость от распространенности заболевания и частоты встречаемости генетического маркера. Показано, что при отношении шансов OR < 2,2 маркер обладает заведомо низкой прогностической эффективностью во всех смыслах при любых частотах заболевания и маркера. Маркер может быть хорошим классификатором, если OR > 5,4, но лишь при условии, что его популяционная частота достаточно высока (pM > 0,3). Приведены формулы, позволяющие в исследованиях типа «случаи–контроли» получать косвенные оценки абсолютных и относительных рисков носительства маркера
Экологическая генетика. 2013;11(1):77-90
77-90
ИССЛЕДОВАНИЕ ПОПУЛЯЦИОННЫХ ЧАСТОТПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ, АССОЦИИРОВАННЫХС ГЕСТОЗОМ
Аннотация
Используя микрочипы высокой плотности, в популяционной выборке проведено исследование полиморфизма >1,5 тыс. генетических маркеров, ассоциированных с риском развития широкого спектра мультифакториальной патологии. На основании функциональной аннотации генов с помощью биоинформационных ресурсов GFINDer и DAVID из выбранных генетических маркеров выделена группа из 31-го гена, продукты которых задействованы в риске развития гестоза. Установлены популяционные частоты аллелей и генотипов для следующих генов: ACE, ADIPOQ, ADRB2, ADRB3, AGT, APOE, CRP, CTLA4, CYP1A1, CYP2D6, CYP2E1, EDNRA, ESR1, ESR2, F5, HLA-DQA1, HSPA1A, IL1A, IL1RN, IL6, IL6R, LEP, LEPR, LPL, MTHFR, NOS3, PON1, TAP2, TGFB1, TNFA, VEGFA. Проведенный сравнительный анализ между российской и среднеевропейской популяционными группами, выявил статистически значимые различия частот аллелей и генотипов для 6 генов: CYP2D6, CTLA4, AGT, NOS3, PON1, ADRB2. Полученные данные свидетельствуют в целом о схожих основах генетического риска сосудистой патологии беременности в российской и европейской популяциях и могут быть использованы при проведении других генетико-эпидемиологических исследований
Экологическая генетика. 2013;11(1):91-100
91-100